์นดํ”Œ๋ž€-๋งˆ์ด์–ด ์ถ”์ •๋ฒ• [Survival analysis]

2023. 1. 10. 11:44ใ†๐Ÿง‘๐Ÿป‍๐Ÿซ Ideas/ํ†ต๊ณ„๋ถ„์„

์ƒ์กด๋ถ„์„, ์ดํƒˆ๋ถ„์„(์ด์ œ๋ถ€ํ„ฐ ์ด ๋‘˜์„ ๊ตฌ๋ถ„ํ•˜์ง€ ์•Š์„ ์˜ˆ์ •)์„ R๊ณผ ํŒŒ์ด์ฌ์„ ํ†ตํ•ด ์ง„ํ–‰ํ•˜๊ฒ ๋‹ค. ๊ทธ ๋ถ„์„์˜ ์ฒซ๋ฒˆ์งธ๋กœ ์นดํ”Œ๋ž€ ๋งˆ์ด์–ด ๊ธฐ๋ฒ•์„ R์„ ํ†ตํ•ด ๊ตฌํ˜„ํ•ด๋ณด์ž.

 

๋จผ์ € ๊ธฐ๋ฒ•์— ๋Œ€ํ•œ ์„ค๋ช…์ด ํ•„์š”ํ•œ๋ฐ, ์นดํ”Œ๋ž€ ๋งˆ์ด์–ด ๊ธฐ๋ฒ•์€ ๋น„๋ชจ์ˆ˜์  ๋ชจํ˜•์ด๋‹ค. ์ด์—, ์–ด๋– ํ•œ ๋ถ„ํฌ์  ๊ฐ€์ •์ด ๋ถˆํ•„์š”ํ•˜๊ณ  ์ ์€ ์ˆ˜์˜ ๋ฐ์ดํ„ฐ๋กœ ์‰ฝ๊ฒŒ ์ƒ์กด์œจ์„ ๊ณ„์‚ฐํ•  ์ˆ˜ ์žˆ๋‹ค๋Š” ์žฅ์ ์ด ์žˆ๋‹ค.

 

๊ทธ๋ฆฌ๊ณ , ์นดํ”Œ๋ž€ ๋งˆ์ด์–ด ๊ธฐ๋ฒ•์€ "์‹ค์ œ ์ดํƒˆ์ด ์ผ์–ด๋‚œ ์‚ฌ๊ฑด๋งŒ ๋ฐ˜์˜ํ•œ๋‹ค"๋ผ๋Š” ์•„์ฃผ ์ค‘์š”ํ•œ ํŠน์ง•์ด ์žˆ๋‹ค.

์ƒ์กด๋ถ„์„์—์„œ ๋ถ„์„๋Œ€์ƒ์ด ์‚ฌ๋ผ์ง€๋Š” ๊ฒฝ์šฐ๋Š” ์‚ฌ๋ง(์ดํƒˆ)ํ•˜๊ฑฐ๋‚˜(event), ์—ฐ๊ตฌ์—์„œ ์ค‘๋„ํƒˆ๋ฝ(censoring)ํ•œ ๋‘ ๊ฐ€์ง€ ๊ฒฝ์šฐ ์ค‘ ํ•˜๋‚˜์ด๋‹ค.

๋ฌผ๋ก  ์‹คํ—˜์— ์žˆ์–ด์„œ ์ค‘๋„ํƒˆ๋ฝ์€ type1, 2, random๊ณผ ๊ฐ™์ด ๋‹ค์–‘ํ•œ ์‚ฌ์œ ๊ฐ€ ์กด์žฌํ•˜๊ณ , ์ด๋Š” ์‹คํ—˜์„ค๊ณ„์— ์žˆ์–ด์„œ ๋งค์šฐ ์ค‘์š”ํ•˜์ง€๋งŒ ์—ฌ๊ธฐ์„œ๋Š” ๋‹ค๋ฃจ์ง€ ์•Š๊ฒ ๋‹ค.

 

์ด๊ฒƒ์„ ์‰ฝ๊ฒŒ ๋– ์˜ฌ๋ฆด ์ˆ˜ ์žˆ๋Š” ๋ฐฉ๋ฒ•์€ ๋ฐ”๋กœ ํœด๋จผ๊ณ ๊ฐ์ด๋‹ค. ํœด๋จผ๊ณ ๊ฐ๋“ค์€ ์˜ค๋žœ ์‹œ๊ฐ„๋™์•ˆ ์šฐ๋ฆฌ ์„œ๋น„์Šค๋‚˜ ์ œํ’ˆ์„ ์ด์šฉํ•˜์ง€ ์•Š์€ ๊ณ ๊ฐ๋“ค์„ ๋งํ•œ๋‹ค. ์šฐ๋ฆฌ๋Š” ๊ทธ๋“ค์„ ์ดํƒˆ๊ณ ๊ฐ์ด๋ผ๊ณ  ๋ด์•ผํ• ๊นŒ? ์ด ๋ฌผ์Œ์˜ ๋Œ€ํ•ด ์นดํ”Œ๋ž€ ๋งˆ์ด์–ด ๊ธฐ๋ฒ•์€ ์‹ค์ œ ์ดํƒˆ๋งŒ์„ ์ดํƒˆ์ด๋ผ๊ณ  ๋ณธ๋‹ค.

 

๋˜ํ•œ ๋ถ„์„ ํ”„๋กœ์ ํŠธ ๋‚ด์ง€๋Š” ์–ด๋– ํ•œ ์‹คํ—˜ ์ƒํ™ฉ์„ ์ง„ํ–‰ํ•ด ์˜ฌ ๋•Œ, ์ด ํœด๋จผ๊ณ ๊ฐ๋“ค์€ ์–ด๋Š ์‹œ์ ๋ถ€ํ„ฐ ๋ฐ˜์‘ํ•˜์ง€ ์•Š๊ณ  ์‚ฌ๋ผ์ง„๋‹ค.

์ด์— ์—ฐ๊ตฌ์ž๋“ค์€ ์ด๋“ค์ด ์ค‘๋„ํƒˆ๋ฝํ–ˆ๋‹ค๊ณ  ํ‘œํ˜„ํ•˜๋Š” ๊ฒƒ์ด๋‹ค. ์นดํ”Œ๋ž€ ๋งˆ์ด์–ด๋Š” ์ด๋“ค์„ ์ดํƒˆ์ด๋ผ๊ณ  ๋ณด์ง€ ์•Š๋Š”๋‹ค.

 

์ฆ‰, ์นดํ”Œ๋ž€ ๋งˆ์ด์–ด ๊ธฐ๋ฒ•์€ ์–ด๋–ค ์‹œ์ ์„ ๋”ฑ ์ž˜๋ผ์„œ ์‹ค์ œ ์ดํƒˆ(ํƒˆํ‡ด ๋“ฑ)์„ ๋ณด์ธ ๊ณ ๊ฐ๋“ค์„ ์ดํƒˆ์ด๋ผ๊ณ  ๋ณด๊ณ , ์ค‘๋„ํƒˆ๋ฝ๋œ ๊ณ ๊ฐ(ํœด๋จผ๊ณ ๊ฐ)๋“ค์€ ์ „์ฒด ์ˆ˜์—์„œ ์ œ์™ธํ•˜๋Š” ์‹์œผ๋กœ ๊ณ„์‚ฐํ•œ๋‹ค. ๊ทธ๋ฆผ์„ ๋ณด์ž.

์œ„ ๋ฐ์ดํ„ฐ์—์„œ X๊ฐ€ ์‹ค์ œ ์ดํƒˆ์ด๋ฉฐ ์น ํ•ด์ง„ O๋Š” ๊ทธ ์‹œ์ ์—์„œ์˜ ์ค‘๋„์ดํƒˆ์„ ๋‚˜ํƒ€๋‚ธ๋‹ค. ์ด๋ฅผ ๋ฐ”ํƒ•์œผ๋กœ ํ™•๋ฅ ๋“ค์„ ๊ณฑํ•ด์„œ ๊ทธ ์‹œ์ ์˜ ๋ˆ„์  ์ƒ์กด์œจ์„ ๊ตฌํ•œ๋‹ค. ์ด๋ ‡๊ฒŒ ๊ตฌํ•œ ํ™•๋ฅ ๋“ค์„ ๊ทธ๋ž˜ํ”„๋กœ ๊ทธ๋ ค๋ณผ ์ˆ˜ ์žˆ๋Š”๋ฐ, ๊ทธ๊ฒƒ์ด ๋ฐ”๋กœ ์นดํ”Œ๋ž€-๋งˆ์ด์–ด ๊ณก์„ ์ด๋‹ค.

์ด๋Ÿฌํ•œ ์ƒ์กด์œจ, ์ƒ์กดํ•จ์ˆ˜ ์ถ”์ •๋ฒ•์€ ๋ˆ„์ ํ•œ๊ณ„์ถ”์ •๋ฒ•์ด๋ผ๊ณ ๋„ ํ•œ๋‹ค.

 

์ค‘์š”ํ•œ ๊ฒƒ์€ ์ƒ์กด์œจ์ด ๋ณ€ํ™”ํ•˜๋Š” ์‹œ์ (t)์€ ์‹ค์ œ ์ดํƒˆ์ด ์ผ์–ด๋‚œ ์‹œ์ ์ด๋‹ค.

 

 

R ์ฝ”๋“œ๋กœ ๊ตฌํ˜„ํ•˜์—ฌ ์‹ค์Šตํ•œ ๊ฒฐ๊ณผ๋Š” ๋‹ค์Œ๊ณผ ๊ฐ™๋‹ค.

 

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[R]์นดํ”Œ๋ž€ ๋งˆ์ด์–ด(kaplan-meier) [Survival Analysis]

R์—์„œ ์นดํ”Œ๋ž€ ๋งˆ์ด์–ด ๊ธฐ๋ฒ•์„ ๊ตฌํ˜„ํ•ด๋ณด์ž ์ด ๋ชจ๋ธ์€ ์ฃผ๋กœ ์˜๋ฃŒ ๋ฐ์ดํ„ฐ์—์„œ ๋งŽ์ด ์ด์šฉ๋˜์ง€๋งŒ, ์šฐ๋ฆฌ๋Š” ๋น„์ฆˆ๋‹ˆ์Šค ๋„๋ฉ”์ธ์œผ๋กœ ์˜ฎ๊ฒจ ๊ณ ๊ฐ๋“ค์˜ ์ƒ์กด, ์ดํƒˆ์„ ๋ถ„์„ํ•ด๋ณธ๋‹ค. ๋ฐ์ดํ„ฐ๋Š” ์—ฐ์Šต ๋ฐ์ดํ„ฐ์ธ surviva

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